MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 chromosome

Total Repeats: 12910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010498	TG	3	6	36	41	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010498	A	7	7	46	52	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010498	AGC	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010498	CAGA	2	8	155	162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010498	ACA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010498	CAC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010498	ACC	3	9	213	221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010498	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010498	T	9	9	301	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010498	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010498	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010498	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010498	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010498	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010498	A	7	7	6382	6388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010498	AAG	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010498	TA	3	6	7911	7916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010498	GGCG	2	8	7973	7980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010498	CGG	2	6	8037	8042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010498	CTGT	2	8	9126	9133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010498	C	6	6	9786	9791	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_010498	G	6	6	9796	9801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010498	ATC	3	9	10393	10401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010498	GAAT	2	8	10402	10409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010498	AAT	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010498	ATA	2	6	10456	10461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010498	GAAAAT	2	12	10499	10510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010498	TAG	2	6	11683	11688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010498	CTG	2	6	11721	11726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010498	AGA	2	6	11733	11738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010498	TTA	2	6	11762	11767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010498	TCAT	2	8	11794	11801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010498	A	6	6	11876	11881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010498	TGA	2	6	11899	11904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010498	TAG	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010498	AGTG	2	8	11938	11945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010498	A	7	7	11953	11959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010498	ATG	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010498	AT	3	6	12026	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010498	A	6	6	14045	14050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010498	CCG	2	6	15274	15279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010498	GCC	2	6	15374	15379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010498	CGG	2	6	15384	15389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010498	ATC	2	6	15416	15421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010498	TGC	2	6	15428	15433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010498	CT	3	6	15441	15446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010498	GACA	2	8	15568	15575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010498	CGC	2	6	15588	15593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010498	TAT	2	6	15594	15599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010498	CT	3	6	15604	15609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010498	AATC	2	8	15665	15672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010498	TTA	2	6	15767	15772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010498	AGA	2	6	15787	15792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010498	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010498	AC	3	6	15874	15879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010498	A	8	8	16023	16030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010498	TCA	2	6	16815	16820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010498	AAT	2	6	16824	16829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010498	ATA	2	6	18335	18340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010498	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010498	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010498	ATA	2	6	18424	18429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010498	TAT	2	6	19712	19717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010498	TAAT	2	8	19727	19734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010498	A	6	6	19805	19810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010498	TCATC	2	10	19811	19820	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010498	A	6	6	19851	19856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010498	ATT	2	6	19860	19865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010498	GAT	2	6	19890	19895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010498	GA	3	6	21169	21174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010498	TA	3	6	22103	22108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010498	TCC	2	6	24185	24190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010498	TC	3	6	25597	25602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010498	A	7	7	25626	25632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010498	ATAC	2	8	25652	25659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010498	TTA	2	6	25680	25685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010498	AAC	2	6	25694	25699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010498	GTTA	2	8	25714	25721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010498	A	7	7	25948	25954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010498	CTT	2	6	26326	26331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010498	GCA	2	6	26449	26454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010498	TTC	2	6	26465	26470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010498	CTT	2	6	26502	26507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010498	TGC	2	6	30914	30919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010498	AGC	2	6	32381	32386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010498	T	6	6	32423	32428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010498	TCAT	2	8	33380	33387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010498	TCCC	2	8	33410	33417	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_010498	TGGC	2	8	33451	33458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010498	TCT	2	6	34552	34557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010498	TGC	2	6	34558	34563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010498	GAT	2	6	39851	39856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010498	GATGC	2	10	39877	39886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010498	CCAG	2	8	39918	39925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010498	CGA	2	6	39952	39957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010498	GAC	2	6	41370	41375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010498	A	6	6	41387	41392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010498	ATT	2	6	41414	41419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010498	GGGC	2	8	43037	43044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010498	CTGA	2	8	43059	43066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010498	GCG	2	6	44337	44342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010498	ATTT	2	8	47137	47144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010498	GTTT	2	8	47154	47161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010498	ATT	3	9	47185	47193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010498	GAG	2	6	47431	47436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010498	ACC	2	6	47538	47543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010498	ACG	2	6	47551	47556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010498	A	7	7	50970	50976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010498	TC	3	6	52333	52338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010498	ATT	2	6	52353	52358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010498	AT	3	6	52376	52381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010498	CTAA	2	8	54843	54850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010498	GCG	2	6	54872	54877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010498	AGA	2	6	55642	55647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010498	TGA	2	6	55663	55668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010498	CTTT	2	8	55742	55749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010498	GTC	2	6	55757	55762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010498	ACATC	2	10	55787	55796	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_010498	CAA	2	6	61284	61289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010498	CAT	2	6	63667	63672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010498	GTG	2	6	63757	63762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010498	GT	3	6	63882	63887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010498	GCG	2	6	64788	64793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010498	ACC	2	6	68450	68455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010498	GTG	2	6	68477	68482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010498	T	7	7	68568	68574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010498	A	6	6	70943	70948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010498	TCCA	2	8	75120	75127	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010498	A	7	7	75127	75133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010498	AG	3	6	75152	75157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010498	A	7	7	75163	75169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010498	AAT	2	6	75238	75243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010498	TAA	2	6	75331	75336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010498	TCT	2	6	75420	75425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010498	G	7	7	76307	76313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010498	C	6	6	76314	76319	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_010498	TTC	2	6	76325	76330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010498	TTAT	2	8	76339	76346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010498	AT	3	6	76345	76350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010498	ATT	2	6	76400	76405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010498	T	7	7	76404	76410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010498	CAT	2	6	76478	76483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010498	AT	3	6	76512	76517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010498	GGCA	2	8	76561	76568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010498	CCA	2	6	76576	76581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_010498	GTT	2	6	76603	76608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010498	A	6	6	76610	76615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010498	ATTC	2	8	76709	76716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010498	A	7	7	76735	76741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_010498	GGCAT	2	10	152049	152058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
292	NC_010498	AAT	2	6	152746	152751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_010498	GTAAG	2	10	152813	152822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010498	CTC	2	6	154537	154542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_010498	GAG	2	6	154556	154561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_010498	AGG	2	6	154618	154623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_010498	TGA	2	6	155081	155086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_010498	GAC	2	6	156960	156965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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319	NC_010498	ATG	2	6	167387	167392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_010498	TAT	2	6	167559	167564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_010498	TTA	2	6	167596	167601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_010498	TG	4	8	202004	202011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_010498	GGA	2	6	234080	234085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_010498	CGT	2	6	234199	234204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_010498	AC	3	6	234300	234305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
425	NC_010498	GTAG	2	8	234341	234348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_010498	CCT	2	6	234441	234446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_010498	TGA	2	6	234489	234494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_010498	GGT	2	6	234531	234536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_010498	GGT	2	6	234566	234571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
431	NC_010498	AGG	2	6	234676	234681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_010498	CCA	2	6	234706	234711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_010498	TAAA	2	8	234725	234732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_010498	A	6	6	234730	234735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_010498	GTT	2	6	234827	234832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_010498	TC	3	6	234839	234844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
437	NC_010498	GT	3	6	235017	235022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
438	NC_010498	AC	3	6	235027	235032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
439	NC_010498	GCG	2	6	235130	235135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_010498	AGC	2	6	235147	235152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_010498	GC	3	6	235198	235203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
443	NC_010498	G	6	6	235291	235296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
444	NC_010498	TCC	2	6	235301	235306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_010498	CTGA	2	8	235321	235328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_010498	GTAC	2	8	235405	235412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_010498	GGA	2	6	235609	235614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
448	NC_010498	AC	3	6	235827	235832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
449	NC_010498	CGTC	2	8	235845	235852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
450	NC_010498	AAC	2	6	235864	235869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_010498	AGC	2	6	235954	235959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_010498	CAT	2	6	235960	235965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_010498	AAAG	2	8	235968	235975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_010498	TG	3	6	236057	236062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_010498	TTG	2	6	236063	236068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_010498	TGA	2	6	236403	236408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_010498	GGT	2	6	236502	236507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_010498	ATG	2	6	236863	236868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_010498	ACC	2	6	237058	237063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_010498	TGG	2	6	237118	237123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
467	NC_010498	TCC	2	6	237144	237149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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469	NC_010498	AGG	2	6	237199	237204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_010498	TGA	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
479	NC_010498	GGC	2	6	237887	237892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
480	NC_010498	GGT	2	6	237901	237906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
481	NC_010498	GGT	2	6	238032	238037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_010498	GAC	2	6	243324	243329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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